В сеансе Wayland нельзя просто так задать привычную комбинацию Alt+Shift для переключения раскладки и так, чтобы работал индикатор на панели.

Но можно задать нужные настройки из консоли:

gsettings set org.gnome.desktop.wm.keybindings switch-input-source "['<Alt>Shift_L']"

Если больше нравится Ctrl+ Shift:

gsettings set org.gnome.desktop.wm.keybindings switch-input-source "['<Ctrl>Shift_L']"

Можно и несколько комбинаций разом:

gsettings set org.gnome.desktop.wm.keybindings switch-input-source "['<Super>space', '<Shift>Alt_L','<Alt>Shift_L']"